长身蛇颈龟拥有一个光滑的,呈椭圆形的背甲,而且相当扁平,沿着其长径有一条轻微的凹陷与背甲等长。背甲为棕色,黑色或暗绿色。腹甲,甲桥和缘盾为奶油色,沿着接缝处长有深棕色或黑色的斑纹。特征性的长脖子几乎与背甲等长。当被人捕捉到时,野生的长身蛇颈龟会从麝香腺中释放出一种气味难闻的液体,而人工饲养的个体往往不会这样。