德国牧羊犬的眼睛大多是棕色或黑色的。如果出现深绿色等其他颜色,则是劣势。德国狗的眼球结构比较特殊。人们还发现,狗可以区分不同深浅的灰色和一些颜色,尤其是蓝色和紫色。
当光线通过视网膜到达德国狗眼球后部的虹膜时,再次被虹膜反射,在视网膜上形成图像,这就是猫狗可以借助弱光在夜间捕猎的原因。虹膜反射的光还是会通过视网膜,这就是为什么狗的眼睛在昏暗的光线下会发光。